Vihreä lippu -ohjelma tukee monin tavoin valtakunnallisten opetus- ja varhaiskasvatussuunnitelmien tavoitteita, mm. kestäviä arjen toimintatapoja, monipuolista ympäristökasvatusta sekä lasten ja nuorten osallisuuden ja vaikuttamisen taitojen edistämistä.